基因芯片“黄海新1号”进一步促进虾种业的快速发展
基因芯片是提高育种效率、培育抗病、抗逆、优质新品种的重要分子工具。近年来,由于虾基因组育种缺乏低成本、高通量的基因芯片,中国水产科学研究院黄海水产研究所的孔杰研究员团队研制出40K SNP基因芯片“黄海新1号”。
根据多代系谱和一步基因组选择技术,“黄海新1号”已应用于对虾的商业化养殖,在提高副溶血弧菌(VpAHPND)和引起急性肝胰腺坏死的白斑综合症病毒(WSSV)的抗性和生长速度方面取得显著进展。
研究团队对全球重要对虾养殖群体和品系的全基因组进行了重测序,获得了600万个有效的SNP标记。综合WSSV抗性、氨氮耐受性、饲料转化效率等相关SNP位点,筛选出45,815个标记,构建了液相芯片。
利用该芯片的基因型检测结果,对VpAHPND和WSSV感染的抗性进行了一步基因组选择,准确率比传统的BLUP方法高29%-91%。该团队已与石家庄博瑞迪生物科技有限公司签约,共同开展育种技术服务和SNP基因型检测服务。目前,“黄海新1号”已在凡纳滨对虾4个遗传育种项目中推广应用,个体2000余个。
南美白对虾40K SNP育种芯片“黄海新1号”的研发,为基因组亲缘关系鉴定、遗传结构和多样性分析、多性状基因组选择提供了重要工具,对进一步推动对虾种业的快速发展具有重要作用。
编辑:jq
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